הגורם למיקרוטיה

האפרכסת מתחילה להתפתח בצוואר העובר בשבוע 5 להריון ונודדת למיקומה הסופי עד שבוע 20 להריון.

ידוע על סינדרומים ומומים הקשורים לעיתים למיקרוטיה .

הסיבה להופעת מיקרוטיה  כמום בודד נחקרה רבות אך עד היום לא נמצאה הסיבה המוכחת להופעתה.
יחד עם זאת קיימות תיאוריות להופעת המיקרוטיה כגון:
בעיה באספקת הדם בזמן ההריון.
לקיחת תרופות על ידי האם בזמן ההריון כמו תלידומיד, Accutane, חומצה רטינואית
כמו כן נבדקו גורמים סביבתיים שונים.